Un repère SmartMark est un repère intelligent qui se positionne et se redimensionne lui-même en fonction de l'objet auquel il est ancré : substrat, film, plaque ou découpe. Si vous remplacez le substrat, le repère se repositionne automatiquement. Vous pouvez repositionner un repère SmartMark en modifiant les paramètres dans la boîte de dialogue Paramètres du repère, ou vous pouvez créer plusieurs copies d'un repère dans la boîte de dialogue et spécifiez la position de chacun. Ces repères contiennent des informations utilisées par le logiciel pour définir leur apparence. Lorsque vous placez un repère SmartMark dans un travail, vous pouvez le déverrouiller et le repositionner. Cependant, en procédant ainsi, le repère n'est plus considéré comme « intelligent ». Il le redevient lorsque vous le verrouillez. Les repères SmartMark peuvent apparaître au-dessus ou au-dessous d'autres objets dans la mise en page.
Le logiciel Pandora propose quatre types de repères SmartMark : barres de couleurs, mouilleurs, barres porteuses et repères de position (repères de centrage et guides latéraux). Vous pouvez également convertir tout repère simple en repère SmartMark en double-cliquant dessus dans la palette Repères, puis en cliquant sur Convertir en repère SmartMark. L'icône d'un repère SmartMark est différente de celle d'un repère simple.